Oddział Niemowlęcy i Patologii Noworodka prowadzi kompleksową diagnostykę i leczenie noworodków, niemowląt oraz dzieci do 2. roku życia. Zakres działalności obejmuje rozpoznawanie i terapię chorób układu noworodkowego, w tym zakażeń, zaburzeń adaptacyjnych, przedłużających się żółtaczek oraz problemów neurologicznych. Oddział zajmuje się także chorobami okresu niemowlęcego, w tym układu oddechowego, moczowego, pokarmowego i nerwowego, współpracując w tym zakresie z poradniami gastroenterologiczną, dermatologiczną i chirurgii małoinwazyjnej. Oddział prowadzi zaawansowaną diagnostykę genetyczną, w tym sekwencjonowanie eksomu i panele diagnostyczne, oraz diagnostykę neurologiczną, ze szczególnym uwzględnieniem zaburzeń neurorozwojowych i napadowych, kierując pacjentów do ośrodków referencyjnych w przypadku chorób rzadkich. Jednostka współpracuje z krajowymi i zagranicznymi ośrodkami naukowymi, zapewniając kompleksową opiekę specjalistyczną.