Oddział Gastroenterologii i Pediatrii leczy dzieci do 18 r.ż., oferując pełną diagnostykę i terapię chorób układu pokarmowego (refluks, zapalenia, celiakia, nieswoiste zapalenia jelit, choroby wątroby, nietolerancje), a także schorzeń pediatrycznych (infekcje, astma, mukowiscydoza, choroby skórne). Udzielamy świadczeń takich jak żywienie dojelitowe i pozajelitowe, gastroduodenoskopia, kolonoskopia, manometria, pH-metria, testy oddechowe i spirometria. Oddział dysponuje Pracownią Endoskopii (diagnostyka i zabiegi endoskopowe, zakładanie PEG, leczenie krwawień, usuwanie ciał obcych) oraz Pracownią Badań Czynnościowych przewodu pokarmowego i układu oddechowego. Prowadzimy programy leczenia biologicznego IBD, żywienia domowego, mukowiscydozy oraz całodobowy dyżur endoskopowy dla dzieci z województwa śląskiego. Współpracujemy z wieloma ośrodkami referencyjnymi (m.in. Warszawa, Katowice, Rabka). Oddział pełni funkcje dydaktyczne (zajęcia dla studentów ŚUM) i naukowe — lekarze uczestniczą w badaniach i publikacjach w pediatrii i gastroenterologii dziecięcej.