Oddział przyjmuje noworodki wymagające obserwacji, monitorowania, diagnostyki lub leczenia – urodzone w USK i szpitalach o niższym stopniu referencyjności. Specjalizuje się w rzadkich wrodzonych chorobach metabolicznych, zakażeniach TORCH, wadach rozwojowych oraz w diagnostyce i terapii przedłużonej żółtaczki. Zapewnia nowoczesne monitorowanie i badania (USG, NIRS, aEEG/EEG, TK/MRI), współpracuje z licznymi klinikami, wykonuje badania genetyczne i metaboliczne. Promuje karmienie piersią i – jeśli to możliwe – hospitalizację mamy razem z dzieckiem. Oddział Fizjologii Noworodka działa w systemie rooming-in (także po cięciu cesarskim, z salą wzmożonego nadzoru), umożliwia fototerapię na sali oraz oferuje sprzęt do stymulacji laktacji i profesjonalne porady doradców laktacyjnych.